Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHPF2Q9P2E5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHPF2Q9P2E5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHPF2Q9P2E5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms