Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRN3Q9NYV6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RRN3Q9NYV6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RRN3Q9NYV6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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