Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC10Q9NYD6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXC10Q9NYD6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXC10Q9NYD6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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