Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms