Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4R2Q9NY27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4R2Q9NY27 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms