Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ALKBH4Q9NXW9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ALKBH4Q9NXW9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms