Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GIN1Q9NXP7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GIN1Q9NXP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GIN1Q9NXP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GIN1Q9NXP7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GIN1Q9NXP7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms