Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ERVK13-1Q9NX77 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVK13-1Q9NX77 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVK13-1Q9NX77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms