Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB20Q9NX57 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB20Q9NX57 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB20Q9NX57 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms