Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS9Q9NV88 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INTS9Q9NV88 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INTS9Q9NV88 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms