Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF13Q9NV06 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF13Q9NV06 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF13Q9NV06 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms