Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC39A9Q9NUM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC39A9Q9NUM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms