Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC3Q9NUD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms