Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMSN1Q9NSI8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMSN1Q9NSI8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SAMSN1Q9NSI8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms