Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC13Q9NSE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ABCC13Q9NSE7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCC13Q9NSE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms