Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT84Q9NSB2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT84Q9NSB2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms