Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TOPORSQ9NS56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOPORSQ9NS56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOPORSQ9NS56 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms