Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS45Q9NRW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms