Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLE3Q9NRF9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLE3Q9NRF9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms