Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR56

MBNL1, Muscleblind-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL1Q9NR56 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBNL1Q9NR56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBNL1Q9NR56 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBNL1Q9NR56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms