Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EXOSC3Q9NQT5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC3Q9NQT5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms