Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPCPD1Q9NPB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPCPD1Q9NPB8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPCPD1Q9NPB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms