Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNPLA8Q9NP80 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA8Q9NP80 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms