Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4F12Q9HCS2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYP4F12Q9HCS2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYP4F12Q9HCS2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms