Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDFQ9HBH1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDFQ9HBH1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDFQ9HBH1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms