Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UPF2Q9HAU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
UPF2Q9HAU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms