Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCAF1Q9H7N4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF1Q9H7N4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms