Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD1Q9H4M9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD1Q9H4M9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD1Q9H4M9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms