Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNMDQ9H2S6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNMDQ9H2S6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNMDQ9H2S6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms