Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLIRPQ9GZT3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms