Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP6Q9GZR1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SENP6Q9GZR1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms