Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2J2Q9GZM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms