Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL4Q9C0H6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL4Q9C0H6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL4Q9C0H6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms