Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPO4Q9C0E2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XPO4Q9C0E2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XPO4Q9C0E2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms