Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXQ1Q9C009 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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