Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM55Q9BYV6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms