Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP3-1Q9BYR8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP3-1Q9BYR8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms