Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6BQ9BYG5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6BQ9BYG5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARD6BQ9BYG5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms