Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PCGF6Q9BYE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PCGF6Q9BYE7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCGF6Q9BYE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms