Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms