Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MS4A8Q9BY19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MS4A8Q9BY19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms