Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRXQ9BXM0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRXQ9BXM0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRXQ9BXM0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PRXQ9BXM0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms