Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HIRIP3Q9BW71 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRIP3Q9BW71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRIP3Q9BW71 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms