Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C2orf88Q9BSF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C2orf88Q9BSF0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms