Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG101Q9BSB4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG101Q9BSB4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms