Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TXNDC17Q9BRA2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TXNDC17Q9BRA2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms