Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLF1Q9BQI6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF1Q9BQI6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms