Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT3Q9BQG1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYT3Q9BQG1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms