Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREX2Q9BQ50 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX2Q9BQ50 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms