Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms